九寨沟景区共有108个湖泊,大部分分布在日则沟和树正沟,它们与瀑布、跌水相伴生,大小形状各异,构成了九寨沟最具特色的群海。九寨沟的海子常常因湖水的深浅、光照和湖底物质的不同,不断地变化着色调,呈现出不同的美景。九寨沟海拔较高,大气辐射中短波辐射较强,加上水体的选择性吸收及散射作用,使得水中发射出的光谱波长“,海子水色湛蓝,宛如一块块蓝宝石镶嵌在群山之中。同时水体的深度、湖底的深色组成物质以峡谷或者湖泊周围的森林植被所带来的阴影.进一步降低了水面的反射,使水体的亮度偏低,更突出了湖泊的深蓝色。在九寨沟众多的诲子中。五彩池、五花海等色彩缤纷,五颜六色。它们豫嵌于谷底,被浓密的森林所包围,湖中水流清澈见底.并呈现宝石蓝、鹅黄、翡翠、橙红等,之所以呈现出这种景象,是与湖中的多种藻类有关。由水底到水面依次生长着黄色颗粒状的苔藓、绿色的轮藻、褐红的红线藻及绿色的杉叶藻等.加上乳白色的湖底钙化沉积的衬托和阳光反射,就形成了这些色彩斑斓的彩池和花海。